فقدان مرکزی تخصصی که به امر بنیادین امامت در حوزه‌های علمیه بپردازد، نیازهای روزافزون جامعه اسلامی و متأسفانه هجمه­‌های پیش رو از سوی مخالفان و معاندان امامت و ولایت، ضرورت تأسیس نهادی مستقل و تخصصی در حوزه امامت را بیش از پیش نمودار می­‌ساخت، تا ضمن پرنمودن خلأهای موجود، پاسخ­گوی نیازهای علمی، آموزشی و فرهنگی در داخل و خارج از کشور باشد.
بنیاد فرهنگی امامت پس از گذشت سال‌ها از تأسیس و بر اساس تجربه‌ی بدست آمده، در سال ۱۴۰۱ با تغییر مدیریت فصل جدیدی را آغاز کرده است.