معاونت آموزش بنیاد امامت اهل بیت علیهم السلام تحت اشراف مدافع حریم امامت و ولایت حضرت آیت الله میلانی دامت برکاته بر آن است تا با راه اندازی بخشهای مختلفی چون: مرکز تخصصی امامت (سطح 3، کلاسیک) ، مدرسه امامت (سنتی)، آموزش مجازی، و دیگر بخشها به تبیین علمی جایگاه امامت در موضوعاتی چون: چیستی امامت، ضرورت آن، ادله اثبات، فضائل و مناقب، و … بپردازد، و از طریق آموزش و تربیت نیروهای متخصص و سربازان مدافع حریم قدسی امامت اهل بیت علیهم السلام، این مسألۀ مهم را در طبقات مختلف مردم جامعه بیان و نهادینه ساخته، و در برابر مطالب و شبهات مخالفین در عرصۀ داخلی و بین المللی پاسخگو باشد.